Groupe des utilisateurs du logiciel R

*Bonjour, Ayant installer un package pour mesurer la similarité sémantique entre gènes (GOSemSim), j'ai un méssage d'erreur dont j'arrive pas à identifier sa source: A priori sa concernce : Error : .onLoad a échoué dans 'loadNamespace' pour 'org.Dm.eg.db' du package (org.Dm.eg.db'), mais lors de son...

Bonjour,

Je voudrais savoir s'il y a un moyen pour donner une couleur à certains labels d'objets, afficher dans un heatmap.

Merci pour votre aide.

Une idée?

benabderrahmane sidahmed a écrit :Bonjour,

Je voudrais vous demander une question concernant la fonction Heatmap,

En fait est ce que c'est possible que après avoir générer un heatmap à partir d'une matrice de distance, de modifier la couleu d'une cellule donnée?

Merci d'avance.

Bonjour,

Je voudrais vous demander une question concernant la fonction Heatmap,

En fait est ce que c'est possible que après avoir générer un heatmap à partir d'une matrice de distance, de modifier la couleu d'une cellule donnée?

Merci d'avance.

Bonjour, Merci pour votre réponse, Oui le vecteur est résultant du cmeans, et DM est généré avec as.dist(matrice_distance), c'est une matrice de distance de 2 dimension ; Objets x Objets. Cordialement Je ne connais pas cette fonction du paquetage e1071. En revanche, le message d'erreur fait état d'u...

Bonjour. Le packetage clusterSim offre pas mal d'index pouvant répondre à votre besoin. En outre, sa documentation est pas mal faite. Codialement. Bonjour, J'ai trouvé cette fonction: fclusterIndex, cependant lorseque je l'éxecute : fclusterIndex(Cluster,DM,index="all") j'ai cette erreur:...

Bonjour,

Ayant une matrice, sur la quelle je voudrais appliquer un Kmeans et un Cmeans,
quelles sont les différentes méthodes pour évaluer les critères de performance interne et externe de chaque cluster.

Cordialement

Bonjour,

Je souhaiterais que le logiciel R me sort des Labels sur des clusters que j'ai obtenu avec la fonction Kmean, ceci de façon automatique:
ex:
sur la figure on voit Cluster1, Cluster2, ...., Clusten : si on a lancé Kmeans avec n en paramètre...

Merci d'avance.

Bonjour, j'ai une matrice symetrique de distance entre une liste d'objets: ob1 ob2 . . . obn ob1 0 0.2 . . . 0.5 ob2 0.2 0 0.3 . . . obn 0.5 0.3 . . . 0 Est-il possible de lancer l'algorithme Kmeans sur cette matrice sous R? Si oui, pourriez vous s'il vous plait me donner un petit exemple d'instruct...

merci pour votre réponse, j'ai fais la conversion de la similarité vers la distance, j'ai eu le dendogramme. donc on doit passer d'une matrice de similarité à une matrice de distance. --ce pendant ce que je veux savoir sachant que c'est ma première utilisation de ce logiciel, c'est qu'il utilise que...

bonjour j'ai une matrice de similarité entre objets, les valeurs sont donc dans [0; 1]. voici une vue générale de ma matrice : g1 g2 g3 g4 g5 g6 g7 g2 0.363550 g3 0.108952 0.887325 g4 0.183513 0.168189 0.185110 g5 0.193806 0.385945 0.190279 0.979429 g6 0.280036 0.937114 0.666441 0.346085 0.968765 g7...