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par Michèle Raffaelli
10 Mai 2017, 09:41
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
Réponses : 16
Vues : 3704

Re: Comparaison de plusieurs Data Frame

Merci beaucoup
Pas toujours simple de partir d'un Script Bash et de le convertir avec R
Mais j'approche du bout du tunnel (enfin pour cette fois en tout cas)

Michèle
par Michèle Raffaelli
10 Mai 2017, 08:03
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
Réponses : 16
Vues : 3704

Re: Comparaison de plusieurs Data Frame

J'ai finalement trouvé un truc assez simple et qui marche (comme quoi je ne me creuse jamais assez la tête ....) >A <- S1s[paste(S1s$ProteinID, S1s$Peptide)%in%paste(S2s$ProteinID, S2s$Peptide),] > B <- S2s[paste(S2s$ProteinID, S2s$Peptide)%in%paste(S1s$ProteinID, S1s$Peptide),] > C <- rbind.data.fr...
par Michèle Raffaelli
09 Mai 2017, 15:00
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
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Re: Comparaison de plusieurs Data Frame

Alors pour celui qui apparait 7 fois dans cet exemple (qui est une dataframe) il faut que ça me sorte les 7 lignes correspondantes. J'ai actuellement fusionné mes dataframe du coup s'il apparait 20 fois une fois toutes les dataframe fusionnées il me faut les 20 lignes correspondantes. J'espère être ...
par Michèle Raffaelli
09 Mai 2017, 13:24
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
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Re: Comparaison de plusieurs Data Frame

Pour connaître les peptides communs aux 5 échantillons, je dirais faire une boucle for avec un if à l'intérieur. Mais il faudrait d'abord créer une liste de base avec tous les peptides possibles : Pour i va de 1 à la fin de ta liste de base , ajouter un peptide à une liste vide si le peptide est da...
par Michèle Raffaelli
09 Mai 2017, 13:22
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
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Re: Comparaison de plusieurs Data Frame

Image

J'ai des résultats de ce type là et je veux obtenir tous les couples Protéines/Peptides en commun pour les 5 Data Frame
De plus j'ai d'autres données (colonnes à droite) et j'aimerai que ça me les intègrent

J'espère que c'est un poil plus clair
par Michèle Raffaelli
09 Mai 2017, 10:34
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
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Re: Comparaison de plusieurs Data Frame

Merci Serge toutefois ce n'est pas exactement ce dont j'ai besoin ...... En fait j'aimerai avoir en résultat une Data Frame avec tous mes peptides d'intérêts (+ d'autres données qui ne sont pas utiles au tri mais qui sont dans les Data Frame de base) Et j'aimerai toutes les occurrences des peptides ...
par Michèle Raffaelli
09 Mai 2017, 09:21
Forum : Questions en cours
Sujet : Comparaison de plusieurs Data Frame
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Comparaison de plusieurs Data Frame

Bonjour, dans le cadre de mon stage je dois comparer plusieurs Data Frame afin d'obtenir une "liste" de Protéines/Peptides présents dans mes 5 échantillons Pour ce faire j'ai utilisé le code suivant : E1 <- E1[paste(E1$ProteinID, E1$Peptide)%in%paste(S3s$ProteinID, S3s$Peptide),] > E1 <- S...
par Michèle Raffaelli
02 Mai 2017, 14:37
Forum : Questions en cours
Sujet : Copier/coller à partir d'un DataFrame
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Re: Copier/coller à partir d'un DataFrame

Merci beaucoup Serge
par Michèle Raffaelli
02 Mai 2017, 14:21
Forum : Questions en cours
Sujet : Copier/coller à partir d'un DataFrame
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Re: Copier/coller à partir d'un DataFrame

AH oui en effet ça fonctionne mieux ainsi j'avais oublié de préciser le type de la case vie mea culpa
Merci beaucoup pour votre aide précieuse
par Michèle Raffaelli
02 Mai 2017, 13:20
Forum : Questions en cours
Sujet : Copier/coller à partir d'un DataFrame
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Re: Copier/coller à partir d'un DataFrame

J'ai essayé après avoir installer tidyverse et pour autant ça ne fonctionne pas (et pourtant je mets le nom de ma df ...)
par Michèle Raffaelli
02 Mai 2017, 10:14
Forum : Questions en cours
Sujet : Copier/coller à partir d'un DataFrame
Réponses : 7
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Copier/coller à partir d'un DataFrame

Bonjour, Je dois traiter des données avec R malheureusement le logiciel me donnant les dites données ne fournit pas un résultat optimal pour cette utilisation. J'ai donc une colonne avec des nom de protéines (lettres, chiffres et caractères spéciaux) sauf que cette mention est écrite qu'une seule fo...

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