Merci beaucoup Pas toujours simple de partir d'un Script Bash et de le convertir avec R Mais j'approche du bout du tunnel (enfin pour cette fois en tout cas)
J'ai finalement trouvé un truc assez simple et qui marche (comme quoi je ne me creuse jamais assez la tête ....) >A <- S1s[paste(S1s$ProteinID, S1s$Peptide)%in%paste(S2s$ProteinID, S2s$Peptide),] > B <- S2s[paste(S2s$ProteinID, S2s$Peptide)%in%paste(S1s$ProteinID, S1s$Peptide),] > C <- rbind.data.fr...
Alors pour celui qui apparait 7 fois dans cet exemple (qui est une dataframe) il faut que ça me sorte les 7 lignes correspondantes. J'ai actuellement fusionné mes dataframe du coup s'il apparait 20 fois une fois toutes les dataframe fusionnées il me faut les 20 lignes correspondantes. J'espère être ...
Pour connaître les peptides communs aux 5 échantillons, je dirais faire une boucle for avec un if à l'intérieur. Mais il faudrait d'abord créer une liste de base avec tous les peptides possibles : Pour i va de 1 à la fin de ta liste de base , ajouter un peptide à une liste vide si le peptide est da...
J'ai des résultats de ce type là et je veux obtenir tous les couples Protéines/Peptides en commun pour les 5 Data Frame De plus j'ai d'autres données (colonnes à droite) et j'aimerai que ça me les intègrent
Merci Serge toutefois ce n'est pas exactement ce dont j'ai besoin ...... En fait j'aimerai avoir en résultat une Data Frame avec tous mes peptides d'intérêts (+ d'autres données qui ne sont pas utiles au tri mais qui sont dans les Data Frame de base) Et j'aimerai toutes les occurrences des peptides ...
Bonjour, dans le cadre de mon stage je dois comparer plusieurs Data Frame afin d'obtenir une "liste" de Protéines/Peptides présents dans mes 5 échantillons Pour ce faire j'ai utilisé le code suivant : E1 <- E1[paste(E1$ProteinID, E1$Peptide)%in%paste(S3s$ProteinID, S3s$Peptide),] > E1 <- S...
Bonjour, Je dois traiter des données avec R malheureusement le logiciel me donnant les dites données ne fournit pas un résultat optimal pour cette utilisation. J'ai donc une colonne avec des nom de protéines (lettres, chiffres et caractères spéciaux) sauf que cette mention est écrite qu'une seule fo...