non-uniform 'Rounding' sampler used ?

[Eric Wajnberg]

Bonjour à tous,

Depuis quelque temps, lorsque je lance R, j'ai le message (warning ?) suivant :

Code : Tout sélectionner

In sys.load.image("chemin vers le nom du fichier .RData", :
   non-uniform  'Rounding' sampler used

Je soupconnais qu'il y avait peut-être un problème dans ce fichier .RData. J'ai douc tout enlever pour ne laisser qu'un object .First() dans lequel il y a effectivement une fonction load() qui pointe vers un autre fichier .RData, mais le problème reste le même. Et je n'ai de toute façon pas de message d'erreur si je lance ce .First à la main.

Il y a autre chose qui pose problème dans la séquence d'initialisation de R au démarrage, mais je ne trouve rien.

Quelqu'un aurait-il une idée de où peut provenir ce problème ? J'ai chercher des idées en vain sur le web.

Toute aide sur ce point serait la bienvenue.

Amicalement, Eric.

[Eric Wajnberg]

Re-bonjour,

Je complète mon post.

En cherchant sur le web, le problème semble venir d'un changement de générateur de nombres aléatoires lors du passage à des versions de R > R3.6.0 (""Rejection" à la place de "Rounding"). Ceci se défini avec l'argument sample.kind de la fontion RNGkind(). On peut voir la situation par exemple avec la fonction sessionInfo().

On peut re-générer le même message d'erreur, pas exemple avec:

Code : Tout sélectionner

set.seed(1, sample.kind="Rounding")
Warning message:
In set.seed(1, sample.kind = "Rounding") :
  non-uniform 'Rounding' sampler used

Ceci dit, je ne vois toujours pas d'où provient le problème dans mon cas, ni même - donc - comment éviter ce warning qui apparait lors du lancement d'une nouvelle session R. Nulle part dans mes codes (surtout ou lancement) j'utilise un set.seed(). R doit surement faire ceci dans mon dos.

Suis-je le seul à avoir ce problème ? Une idée pour me sortir de ce truc ?

Une fois encore, merci pour toute aide sur ce point.

Cordialement, Eric.

[Gabriel Terraz]

Bonjour,
Ton premier message n'est pas très clair, mais je crois comprendre que tu as toujours ta fonction .First() qui charge un Rdata au démarrage. Supprime donc cette ligne de code, non ?

[Eric Wajnberg]

Bonjour,
Ton premier message n'est pas très clair, mais je crois comprendre que tu as toujours ta fonction .First() qui charge un Rdata au démarrage. Supprime donc cette ligne de code, non ?

Déjà essayé. Ca ne change rien. Qui plus est, comme je l'ai dit, si je lance cette fonction .First() à la main, je n'ai pas le message d'erreur.

A force de creuser, je pense qu'il y a un set.seed() quelque part dans toute la procédure de démarrage de R (qui ne vient pas de moi, donc) qui pose problème.

Dit d'une manière différente, quelqu'un sait-il comment (et surtout où et quand) R initialise ses fonctions de tirage aléatoire ?

Toute autre idée est la bienvenue !

Merci encore, Eric.

[Eric Wajnberg]

Bon, j'avance encore :

Je suis sous Windows, et R est lancé avec la commande :

Code : Tout sélectionner

Rgui.exe --cd-to-userdocs

Si je lance R sans cet argument "--cd-to-userdocs" alors je n'ai plus de message d'erreur.

Cet argument lance R dans sa directory d'accueil par défaut, i.e., C:\Users\user_name\Documents.

Et effectivement, si je vire le .RData dans cette directory, et que je garde l'argument "--cd-to-userdocs", alors je n'ai plus d'erreur. Il y a donc un objet (ou plusieurs) dans ce .RData qui pose problème, mais ce n'est pas le .First(). Quoi d'autres ?

Une fois dans R, si je lance l'instruction suivante :

Code : Tout sélectionner

ls(all.names=TRUE)

(qui me permet de voir tous les objects qui s'y trouvent), je réccupére la liste suivante:

Code : Tout sélectionner

[1] ".First"          ".JavaGuiOptions" ".Last.fixed"     ".Last.value"     ".Random.seed"

Le seul object "suspect" ici est .Random.seed, mais c'est une suite d'entiers (voire la documentation de cet object). Je ne vois pas bien pourquoi ça serait cet object qui poserait problème..

Bref, j'avance, certes, mais je n'ai toujours pas d'idée pour débloquer la situation..

Eric.

[Maxime Deniaux]

Bonsoir,

je suis la conversation, mais je ne peux pas aider. Je ne comprends pas grand chose à cette partie de " l'informatique " si je peux dire ça comme ça.

Mais il me semblait que tu disais que c'était un warning et non un message d'erreur, donc in fine, quel est l'impact de ça sur ton travail par exemple ?
Est-ce que tu as remarqué quelque chose qui n'allait pas au-delà de ce message ?

Ou est-ce que tu as lancé ce sujet juste par "curiosité" on va dire, pour tenter de comprendre pourquoi ça affiche cela.

[Eric Wajnberg]

Non, c'est juste un warning, aux dires de ce qui disent les gens sur le web. Mais ce message d'erreur m'agace, et j'aimerais bien comprendre...

Eric.