Shannon et Equitabilité

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Modérateur : Groupe des modérateurs

Benoit Geslin
Messages : 17
Enregistré le : 23 Mar 2009, 12:24

Shannon et Equitabilité

Messagepar Benoit Geslin » 24 Mar 2009, 08:51

Bonjour à tous(tes),
Je voudrais savoir si vous savez comment réaliser un test de shannon
ainsi qu'un test d'équitabilité sous R.
On m'a conseiller de telecharger le Package Vegan..ce que j'ai fait mais
je ne vois pas cette fonction décrite dans le package...
si quelqu'un sait comment je peut réaliser ces test cela m'aiderai beaucoup

Merci d'avance...

Benoit

Serge Rapenne
Messages : 1426
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Messagepar Serge Rapenne » 24 Mar 2009, 09:20

Va voir du coté du package pgirmess qui contient une fonction shannon (http://finzi.psych.upenn.edu/R/library/pgirmess/html/shannon.html)

Pour ce genre de question utilise la fonction RSiteSearch de R. Un RSiteSearch("Shannon") m'a donner la réponse ci-dessus en 10 secondes

Cordialement

Serge

Benoit Geslin
Messages : 17
Enregistré le : 23 Mar 2009, 12:24

Messagepar Benoit Geslin » 24 Mar 2009, 09:38

Merci beaucoup pour la réponse...
Je ne connaissais pas l'utilité de Site search...maintenant je saurai...

Merci encore

Nicolas Péru
Messages : 1408
Enregistré le : 07 Aoû 2006, 08:13

Messagepar Nicolas Péru » 24 Mar 2009, 12:48

Dans vegan c'est la fonction diversity qui contient l'indice de Shannon par défaut. Il ya aussi Simpson sous diverses formes.
L'équitabilité se dérive directement, elle n'est pas incluse car c'est pas nécessaire.

Benoit Geslin
Messages : 17
Enregistré le : 23 Mar 2009, 12:24

Messagepar Benoit Geslin » 25 Mar 2009, 14:27

Merci pour l'info...j'ai réussi a faire ce que je voulais...


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