description de clusters par les modalités de variables après HCPC

[Hermione Koussihouèdé]

Bonjour,
J’ai effectué une classification hierarchique sur composante principale issue d’une acm grâce à la fonction HCPC de R.
J’ai extrait dans la liste « Results for the Hierarchical Clustering on Principal Components », l’objet res.hcpc$desc.var$category mais je n’en comprends pas les sorties.

Ensuite, Il m’a été suggéré la fonction catdes pour y arriver plus aisément… dois-je prendre en compte cette suggestion ou dois-je préférer les objets de la liste de résultat ??
Si oui ( i.e je prends par catdes) : comment m’y prendre. Dans mon cas,que veut dire concrètement chaque argument dans le code « catdes (donnee,num.var,proba = 0.05, row.w = NULL) » ? et quels seront les descripteurs de classe ?
Si non ( i.e je me fie à l’objet « res.hcpc$desc.var$category ») : que veulent dire alors les sorties « Cla/Mod ; Mod/Cla ;Global ; p.value ;v.test » ; quelles sont concrètement les descripteurs des classes? Toutes les modalités qui y figurent ...?

je serai vraiment ravie si vous pouviez m’aider.

Merci d’avance 

[Florent Aubry]

Tout d'abord une erreur faite souvent, la fonction HCPC ne fait partie de R au sens où les fonctions qui 'font partie' de R sont celles du noyau. Elle fait partie d'un package, en l'occurrence FactoMineR, écrite par l'équipe de Jérôme Pagés. Il existe une nombreuse documentation sur ce package, dont un site spécifique, des publications, des vidéos et un livre (Livre Analyse de données avec R (2e édition). Auteurs : F. Husson, S. Lê & J. Pagès. Editeur : Presses Universitaire de Rennes).

Pour des références : http://factominer.free.fr/docs/references-fr.html