post hoc : après un Kruskal Wallis

[Sébastien Boutry]

bonjour,

une question de statistique, j'aimerai savoir quel post hoc vous me conseiller après un Kruskal Wallis.
le test de Behrens Fisher est il appoprié? comment interpreter les résultats avec les 2 p-value de sortie?

merci

Seb

[Logez Maxime]

Bonjour,

Il est difficile de répondre à ce genre de questions sans savoir ce que tu cherches à tester (quelle est la question que tu te poses) ni sans avoir une petite idée des données. Par exemple pourquoi avoir utiliser un test de Kruskal Wallis ? etc.

Maxime

[Sébastien Boutry]

j'ai utilisé un test de Kruskal Wallis car je dois utiliser un test non paramétrique pour différencier mes groupes qui sont indépendants
mais je voulais juste savoir si vous avez une idée sur un test post hoc à faire
et si vous utilisez le test de Behrens Fisher après un Kruskal pour comparer deux à deux vos données
j'espère que je suis plus clair

merci
cordialement
Seb

[Logez Maxime]

Re,

j'ai utilisé un test de Kruskal Wallis car je dois utiliser un test non paramétrique pour différencier mes groupes qui sont indépendants

C'est un peu plus clair mais qu'est-ce qui vous oblige à utiliser un test non paramétrique ? problème d'homogénéité de variance ? etc ...

Maxime

[Sébastien Boutry]

tout simplement mes données n'ont pas une distribution gaussienne....voila
mais ma question est un test post hoc à la suite d'un test de Kruskal Wallis???
merci et désolé de sauter certaines étapes

Seb

[Logez Maxime]

Re,


Ce n'est pas si "simple" que ça, puisque si tu as suffisement de données la normalité n'est pas le facteur le plus important, contrairement à l'homogénéité des variances, donc si celle-ci est avérée tu peux utiliser des tests paramétriques et revenir à des tests de comparaison deux a deux ...

Maxime

[Sébastien Boutry]

bon je savais pas que l'on pouvais reprendre les tests paramétrique si la normalité n'est pas vérifié et si l'homoscédasticité est vérifié mais de toutes façon le test de levene ne permet pas de faire cela donc je dois faire du non paramétrique
merci pour ces renseignements
Seb

[Logez Maxime]

Re,

tu peux essayer la méthode de Tukey pour comparer des moyennes deux à deux :

Code : Tout sélectionner

y <- rnorm(100)
x <- gl(4,25)
aov1 <- aov(y~x)
TukeyHSD(aov1)
  Tukey multiple comparisons of means
    95% family-wise confidence level

Fit: aov(formula = y ~ x)

$x
           diff        lwr       upr     p adj
2-1 -0.08263747 -0.8061557 0.6408807 0.9906855
3-1 -0.11178888 -0.8353071 0.6117293 0.9775850
4-1  0.14619913 -0.5773191 0.8697173 0.9520152
3-2 -0.02915142 -0.7526696 0.6943668 0.9995786
4-2  0.22883660 -0.4946816 0.9523548 0.8415588
4-3  0.25798802 -0.4655302 0.9815062 0.7875959


Maxime

[Sébastien Boutry]

Re
Dans l'exemple que tu viens de faire, tu pars d'une anova tandis que moi je voudrai un post hoc qui suit un test de Kruskal Wallis (non paramétrique).
Cordialement

Seb[/img]

[Samir Messad]

Bonjour,

en toute logique, on voudrait faire des tests de comparaisons multiples non paramétriques après avoir tester globalement les moyennes avec un K-W.
voir le package npmc. Il y a peut être d'autres fonctions dans d'autres packages qui s'emploient à cette tâche.
Je sais également que l'on peut employer la même démarche que pour le test de comparaison (paramétrique) de Newman-Keuls. La statistique de test utilise alors des sommes alors à la place des moyennes. Précisions et détails page 540 in Sherrer, 1984, Biostatistique. Gaetan Morin Editeur.

Cordialement.

[Samir Messad]

mon précédent message était tronqué : "La statistique de test utilise alors des sommes de rang à la place des moyennes".
Désolé.

[Sébastien Boutry]

Je sais également que l'on peut employer la même démarche que pour le test de comparaison (paramétrique) de Newman-Keuls. La statistique de test utilise alors des sommes alors à la place des moyennes. Précisions et détails page 540 in Sherrer, 1984, Biostatistique. Gaetan Morin Editeur.

J'avais lu cela dans cet ouvrage mais dans R j'ai simplement trouvé la librairie npmc avec le test de Behrens Fisher associé
mais je voulais savoir si il y avait d'autres solutions merci
cordialement
Seb

[Bertrand Villeneuve]

Bonjour Sébastien,
Tu dois pouvoir trouver ce que tu cherches ici :
http://www.biostat.wustl.edu/archives/h ... 00245.html
A+

[Sébastien Boutry]

C'est pas évident d'apprendre sur le tas :D
Merci pour le lien
Cordialement
Seb